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Mise à jour le 02.04.2026

État écologique des eaux de surface

L’indicateur de l’état écologique d’une masse d’eau renseigne du bon ou mauvais fonctionnement des écosystèmes aquatiques. Ainsi, pour qu’une masse d’eau superficielle soit considérée comme étant en « bon état écologique », elle doit être à la fois en bon état biologique, en bon état physico-chimique et ne pas dépasser des valeurs seuils pour certains polluants spécifiques.

état écologique

12% des cours d’eau en Pays de la Loire sont en bon état écologique d’après les critères de la DCE. 

À l’échelle de toutes les masses d’eau de surface en Pays de la Loire, ce sont 12.8% des masses d’eau qui sont en bon état. L’objectif du SDAGE Loire-Bretagne 2022-2027 vise 61% des masses d’eau en bon état d’ici à 2027 (Source : État des lieux 2025, Agence de l’eau Loire-Bretagne).

  • Une masse d’eau est en très bon état : il s’agit d’une masse d’eau côtière située au sud de la Vendée (Sud Sables-d’Olonne).
  • 58 masses d’eau sont en bon état écologique : la grande majorité (49 masses d’eau) sont des masses d’eau « cours d’eau », situées principalement sur la partie Nord/Nord-Est du territoire.
  • Plus de la moitié des masses d’eau (260 masses d’eau soit 57%) sont en état médiocre ou mauvais.

L’état des lieux

L’état écologique des masses d’eau peut être déterminé lors d’un diagnostic territorial : il s’agit de l’état des lieux. Afin de suivre et analyser les obstacles à la reconquête du bon état des eaux selon la DCE, le comité de bassin réalise un état des lieux tous les six ans. Ce diagnostic permet d’orienter les politiques de l’eau des territoires, et de fixer les objectifs environnementaux du SDAGE.

Au-delà de l’évaluation de la qualité de l’ensemble des masses d’eau du bassin Loire-Bretagne, l’état des lieux identifie les pressions qui pèsent sur elles à l’heure actuelle, et les anticipe sur les huit prochaines années. Le dernier état des lieux a été réalisé en 2025 sur base des mesures de qualité des eaux de 2023. L’état des lieux précédent a été publié en 2019 et est accessible ici.

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La carte complète de l’état des lieux du bassin Loire-Bretagne est accessible sur le site de l’agence de l’eau.

Il est également possible de consulter les données de l’état des lieux réalisé par les autres agences de l’eau sur le site Cyclope.

Bilan régional

La région Pays de la Loire se trouve à cheval sur deux bassins hydrographiques : très majoritairement sur le bassin Loire-Bretagne (99% de sa surface), et une partie sur le bassin Seine-Normandie (5 masses d’eau seulement). Il y a donc au total 454 masses d’eau de surface recensées sur la région (tout type de masses d’eau de surface confondu, et disposant de plus de 1% de la surface de la masse d’eau sur le territoire). 

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Des masses d’eau majoritairement en mauvais état

  • Une masse d’eau est en très bon état : il s’agit d’une masse d’eau côtière située au sud de la Vendée (Sud Sables-d’Olonne).
  • 58 masses d’eau sont en bon état écologique (soit 12%) : la grande majorité (49 masses d’eau) sont des masses d’eau « cours d’eau », situées principalement sur la partie Nord/Nord-Est du territoire.
  • Plus de la moitié des masses d’eau (260 masses d’eau soit 57%) sont en état médiocre ou mauvais.
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L’indicateur de l’état écologique intègre de nombreux paramètres (33) et se calcule sur base de l’élément déclassant (un seul paramètre moins que bon suffit à déclasser l’état). En outre, les dynamiques de restauration des écosystèmes peuvent être lentes à se manifester.

Cet indicateur est donc à mettre en perspective, car il peut masquer les actions territoriales qui tendent vers la restauration de l’état des masses d’eau. Plus d’informations sur les actions déployées à l’échelle des territoires ici.

Amélioration de l’état des connaissances

Depuis 2006, les connaissances et le suivi des masses d’eau ont été fortement renforcés, notamment à travers le déploiement d’un réseau de mesures de suivi sur le terrain. En 2017, l’état des lieux s’appuie sur des mesures effectives dans le milieu pour 99% des eaux. 

Ces mesures ont permis de lever les doutes sur les masses d’eau simulées en état « moyen », mais de façon contrastée d’un département à l’autre. Globalement, le nombre de masses d’eau en bon état oscille autour de 11 % avec des départements où les mesures ont pu donner de bonnes surprises jusqu’en 2017 comme la Sarthe, mais d’autres où les mesures ont pu entrainer la réduction le nombre de masses d’eau auparavant simulées comme en bon état (analyses menées par la délégation Maine-Loire-Océan de l’Agence de l’eau Loire-Bretagne, décembre 2021).

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Les causes de dégradation

La région des Pays de la Loire est la région la plus dégradée du bassin Loire-Bretagne avec le plus faible nombre de masses d’eau en bon état, et celle présentant le plus de masses d’eau en mauvais état. Les causes de dégradation sont multiples et plusieurs facteurs permettent d’expliquer ce déclassement.

Les pollutions diffuses par les pesticides et les nitrates d’origine agricole : Près de 80% des masses d’eau sont à risque pour ce type de pollution. Ce sont principalement les masses d’eau plans d’eau et cours d’eau qui sont concernées. 

Les prélèvements et la sévérité des étiages : 75% des masses d’eau cours d’eau présentent une pression significative sur le paramètre « hydrologie ». Le territoire se trouve en grande partie sur un socle granitique, ce qui implique de faibles réserves en eau souterraine et des étiages marqués dans la majorité des cours d’eau. La région est fortement impactée par les prélèvements d’eau pour divers usages (potable, agricole, industriel), ce qui exacerbe les déficits quantitatifs et entraîne fréquemment des assecs. De plus, la très grande majorité de l’eau prélevée en région est issue d’eau continentale. Enfin, le nombre important de plans d’eau (plus de 50 000 plans d’eau de plus de 1000 m²) a des impacts significatifs. Leur présence peut provoquer une perte de débit par évaporation, des ruptures de la continuité écologique, l’ennoiement des cours d’eau et zones humides, une augmentation de la température de l’eau, une eutrophisation, et des modifications des peuplements piscicoles.

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Cartographie des masses d’eau subissant une pression significative pour le paramètre « pesticides »

Les ruptures de continuité et les altérations de l’intégrité physique des milieux aquatiques : plus de 69% des masses d’eau présentent une pression significative sur le paramètre « morphologie ». La dégradation des milieux aquatiques est amplifiée par l’artificialisation des bassins versants. Le remembrement, la destruction des haies, la dégradation des fonctionnalités, la disparition des zones humides, la présence de retenues collinaires, le drainage et l’imperméabilisation des sols, l’urbanisation, sont autant d’aménagements ou d’atteintes aux milieux qui retardent ou accélèrent l’écoulement des eaux, limitent l’effet régulateur des zones humides et modifient l’hydrologie et le substrat des cours d’eau (voir Plan État Région des Pays de la Loire).


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